Claude Code
Copy command
git clone https://github.com/Rimagination/root-measure.gitInstall
- 1克隆仓库
- 2安装 RhizoVision Explorer CLI（rv.exe）
- 3按仓库文档配置环境
- 4告诉 agent「分析这个根系图像」
Metadata
当前主要支持 Windows 平台。
Earth Science
RO
Root Measure
Rimagination · May 24, 2026
根系形态测量 skill，基于 RhizoVision Explorer 的自动化根系图像分析，测量根长、表面积、直径、分支等性状。
Root Measure 是一个基于 RhizoVision Explorer 的根系形态测量 skill。它自动化根系扫描图像的分析流程，测量根长、表面积、投影面积、体积、根尖数、分支点、分支频率、直径分布等性状。支持断根和整根两种分析模式。.
Use cases
Use cases
- 从扫描仪图像自动测量根系形态性状.
- 批量处理大量根系样本.
- 生成根系性状的结构化 CSV 报告.
- 可视化根系分析结果（viewer.html）.
Not for
Not for
- 不适合活体根系的原位测量（需要扫描图像）.
- 不适合非根系的植物器官测量（用 leaf-measure 测叶片）.
Install
Install
Install
Install
Key Notes
Key Notes
- Root Measure 是一个根系形态测量 skill，基于经过验证的 RhizoVision Explorer CLI 工作流。它把根系图像分析的过程自动化——你只需要提供扫描仪拍摄的根系图像，它就能自动测量各种形态性状。.
SKILL.md
SKILL.md
SKILL.md
SKILL.md
这是什么
Root Measure 是一个根系形态测量 skill，基于经过验证的 RhizoVision Explorer CLI 工作流。它把根系图像分析的过程自动化——你只需要提供扫描仪拍摄的根系图像，它就能自动测量各种形态性状。
测量的性状
| 性状 | 说明 |
|---|---|
| 根长 | 总根系长度 |
| 表面积 | 根系总表面积 |
| 投影面积 | 根系投影面积 |
| 体积 | 根系总体积 |
| 根尖数 | 根尖数量 |
| 分支点 | 分支点数量 |
| 分支频率 | 单位长度的分支数 |
| 直径分布 | 平均、中位、最大直径 |
两种分析模式
- 断根模式（broken roots）：适用于洗根后分离的根段，适合高对比度白底扫描图像
- 整根模式（whole root）：适用于完整的根系、根冠或幼苗图像，保留根系结构信息
输出文件
每次分析生成：
features.csv— 性状数据表viewer.html— 可视化结果viewer-data.json— 结构化数据run_manifest.json— 运行记录- 分割/叠加图像
为什么值得用
根系形态分析是植物科学和农学的基础工作，但手动测量极其耗时。Root Measure 把整个流程自动化，从图像输入到性状数据输出只需几分钟，而且支持批量处理。输出的 CSV 可以直接用于统计分析。