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bio-clip-seq-clip-alignment

维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日

Align CLIP-seq reads with STAR; handle unique mappers.

OpenClawNanoClaw分析处理复现实验bio-clip-seq-clip-alignment🧠 bioos extended suitebioos extended bioinformatics suitealign

原始来源

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills

https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-clip-seq-clip-alignment

维护者
FreedomIntelligence
许可
MIT
最近更新
2026年4月1日

技能摘要

来自 SKILL.md 的关键信息

2 min

核心说明

  • samtools index aligned.bam。
  • umi_tools dedup \ --stdin=aligned.bam \ --stdout=deduped.bam。

原始文档

SKILL.md 摘录

Index

samtools index aligned.bam

适用场景

  • Use bio-clip-seq-clip-alignment ，用于 genomics 、 bioinformatics workflows。
  • Apply bio-clip-seq-clip-alignment to sequencing，variant，或 omics analysis tasks。

不适用场景

  • Do not rely on this catalog entry alone ，用于 installation 或 maintenance details。

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  • clip-peak-calling - Call peaks

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