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bio-clip-seq-clip-motif-analysis

维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日

Discover RBP binding motifs from CLIP-seq peak sequences.

OpenClawNanoClaw分析处理复现实验bio-clip-seq-clip-motif-analysis🧠 bioos extended suitebioos extended bioinformatics suitediscover

原始来源

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills

https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-clip-seq-clip-motif-analysis

维护者
FreedomIntelligence
许可
MIT
最近更新
2026年4月1日

技能摘要

来自 SKILL.md 的关键信息

2 min

核心说明

  • bedtools getfasta -fi genome.fa -bed peaks.bed -fo peaks.fa。
  • findMotifs.pl peaks.fa fasta output_dir \ -len 6，7，8 \ -rna。

原始文档

SKILL.md 摘录

HOMER known motif scan

findMotifs.pl peaks.fa fasta output_dir
-rna
-known

适用场景

  • Use bio-clip-seq-clip-motif-analysis ，用于 genomics 、 bioinformatics workflows。
  • Apply bio-clip-seq-clip-motif-analysis to sequencing，variant，或 omics analysis tasks。

不适用场景

  • Do not rely on this catalog entry alone ，用于 installation 或 maintenance details。

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  • clip-peak-calling - Get peaks
  • chip-seq/motif-analysis - General motif concepts

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