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数据与复现
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bio-data-visualization-circos-plots
维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日
bio-data-visualization-circos-plots：Circular genome visualization ，支持 Circos 或 pycirclize。
原始来源
FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills
https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-data-visualization-circos-plots
- 维护者
- FreedomIntelligence
- 许可
- MIT
- 最近更新
- 2026年4月1日
技能摘要
来自 SKILL.md 的关键信息
核心说明
- Circular genome visualizations ，用于 displaying multiple data tracks around chromosome ideograms。
- karyotype = data/karyotype.human.hg38.txt。
- <ideogram> <spacing> default = 0.005r </spacing> radius = 0.90r thickness = 20p fill = yes </ideogram>。
- <image> dir = output file = circos.png png = yes svg = yes radius = 1500p </image>。
- <<include etc/colors_fonts_patterns.conf>> <<include etc/housekeeping.conf>>。
原始文档
SKILL.md 摘录
Tool Options
| Tool | Language | Best For |
|---|---|---|
| Circos | Perl/CLI | Publication-quality, complex layouts |
| pyCircos | Python | Programmatic generation, integration |
| circlize | R | Quick plots, Bioconductor integration |
Installation
conda install -c bioconda circos
## Basic Configuration
Circos requires configuration files defining the plot structure.
适用场景
- Use bio-data-visualization-circos-plots to prepare 论文级图表。
- Apply bio-data-visualization-circos-plots when results need clear visual communication。
不适用场景
- Do not rely on this catalog entry alone ，用于 installation 或 maintenance details。
上游相关技能
- data-visualization/genome-tracks - Linear genome visualization
- hi-c-analysis/hic-visualization - Hi-C-specific circos
- copy-number/cnv-visualization - CNV visualization
- variant-calling/structural-variant-calling - SV data for circos
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