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bio-data-visualization-color-palettes

维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日

Scientific color palettes: colorblind-safe, perceptually uniform, diverging.

OpenClawNanoClaw分析处理复现实验bio-data-visualization-color-palettes🧠 bioos extended suitebioos extended bioinformatics suitescientific

原始来源

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills

https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-data-visualization-color-palettes

维护者
FreedomIntelligence
许可
MIT
最近更新
2026年4月1日

技能摘要

来自 SKILL.md 的关键信息

2 min

核心说明

  • ggplot(df，aes(x，y，color = value)) + geom_point() + scale_color_viridis_c()。
  • ggplot(df，aes(x，y，color = group)) + geom_point() + scale_color_viridis_d()。

原始文档

SKILL.md 摘录

Palette Types

TypeUse CaseExample
SequentialContinuous data (expression, coverage)viridis, Blues
DivergingCentered data (fold change, z-score)RdBu, coolwarm
QualitativeCategories (clusters, conditions)Set1, tab10

Options: viridis, magma, plasma, inferno, cividis, turbo

scale_color_viridis_c(option = 'magma') python import matplotlib.pyplot as plt

plt.scatter(x, y, c=values, cmap='viridis')

Sequential

scale_fill_brewer(palette = 'Blues') scale_color_distiller(palette = 'YlOrRd', direction = 1)

适用场景

  • Use bio-data-visualization-color-palettes ，用于 genomics 、 bioinformatics workflows。
  • Apply bio-data-visualization-color-palettes to sequencing，variant，或 omics analysis tasks。

不适用场景

  • Do not rely on this catalog entry alone ，用于 installation 或 maintenance details。

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  • data-visualization/heatmaps-clustering - Heatmap colors
  • data-visualization/specialized-omics-plots - Plot styling

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