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bio-epitranscriptomics-modification-visualization

维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日

bio-epitranscriptomics-modification-visualization：可视化 RNA modification profiles 、 metagene plots。

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原始来源

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills

https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-epitranscriptomics-modification-visualization

维护者: FreedomIntelligence
许可: MIT
最近更新: 2026年4月1日

技能摘要

来自 SKILL.md 的关键信息

2 min

核心说明

peaks <- import('m6a_peaks.bed')。
GuitarPlot( peaks，txdb = TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，saveToPDFprefix = 'm6a_metagene' )。

原始文档

SKILL.md 摘录

Metagene Plots with Guitar

library(Guitar)
library(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene)

## Create bigWig from IP/Input ratio

bamCompare -b1 IP.bam -b2 Input.bam \
    --scaleFactors 1:1 \
    --ratio log2 \
    -o IP_over_Input.bw

## Metagene around stop codons

computeMatrix scale-regions \
    -S IP_over_Input.bw \
    -R genes.bed \
    --regionBodyLength 2000 \
    -a 500 -b 500 \
    -o matrix.gz

plotProfile -m matrix.gz -o metagene.pdf

适用场景

Use bio-epitranscriptomics-modification-visualization to prepare 论文级图表。
Apply bio-epitranscriptomics-modification-visualization when results need clear visual communication。

不适用场景

Do not rely on this catalog entry alone ，用于 installation 或 maintenance details。

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