数据与复现生物信息与基因组学FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills数据与复现

bio-expression-matrix-metadata-joins

维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日

Join sample metadata to expression matrices for downstream analysis.

OpenClawNanoClaw分析处理复现实验bio-expression-matrix-metadata-joins🧠 bioos extended suitebioos extended bioinformatics suitejoin

原始来源

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills

https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-expression-matrix-metadata-joins

维护者: FreedomIntelligence
许可: MIT
最近更新: 2026年4月1日

技能摘要

来自 SKILL.md 的关键信息

2 min

核心说明

metadata = pd.read_csv('sample_info.csv'，index_col=0)。
counts = pd.read_csv('counts.tsv'，sep='\t'，index_col=0)。

原始文档

SKILL.md 摘录

Load Sample Metadata

import pandas as pd

## Metadata: samples x attributes

metadata = pd.read_csv('metadata.csv', index_col=0)

## Ensure sample order matches

common_samples = counts.columns.intersection(metadata.index)
counts = counts[common_samples]
metadata = metadata.loc[common_samples]

适用场景

Use bio-expression-matrix-metadata-joins ，用于 genomics 、 bioinformatics workflows。
Apply bio-expression-matrix-metadata-joins to sequencing，variant，或 omics analysis tasks。