数据与复现生物信息与基因组学FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills数据与复现

bio-genome-assembly-metagenome-assembly

维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日

Metagenome assembly reconstructs genomes from mixed microbial communities. Long reads enable recovery of complete circular genomes and resolution of strain-level differences.

OpenClawNanoClaw分析处理复现实验bio-genome-assembly-metagenome-assembly🧠 bioos extended suitebioos extended bioinformatics suitemetagenomic

原始来源

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills

https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-genome-assembly-metagenome-assembly

维护者: FreedomIntelligence
许可: MIT
最近更新: 2026年4月1日

技能摘要

来自 SKILL.md 的关键信息

2 min

核心说明

Metagenome assembly reconstructs genomes ，面向 mixed microbial communities. Long reads enable recovery of complete circular genomes 、 resolution of strain-level differences。
flye --nano-raw reads.fastq.gz \ --meta \ --out-dir flye_meta \ --threads 32。

原始文档

SKILL.md 摘录

PacBio HiFi metagenome

flye --pacbio-hifi reads.hifi.fastq.gz
--meta
--out-dir flye_meta_hifi
--threads 32

Illumina paired-end metagenome

metaspades.py -1 R1.fastq.gz -2 R2.fastq.gz
-o spades_meta
-t 32
-m 500

With multiple libraries

metaspades.py
--pe1-1 lib1_R1.fq.gz --pe1-2 lib1_R2.fq.gz
--pe2-1 lib2_R1.fq.gz --pe2-2 lib2_R2.fq.gz
-o spades_meta -t 32

适用场景

Use bio-genome-assembly-metagenome-assembly ，用于 genomics 、 bioinformatics workflows。
Apply bio-genome-assembly-metagenome-assembly to sequencing，variant，或 omics analysis tasks。