BI
数据与复现
bio-blast-searches
bio-blast-searches：运行 BLAST searches against local 或 remote databases ，用于 sequence homology。
FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills查看
数据与复现
BI
bio-local-blast
维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日
bio-local-blast：Set up 、 run BLAST+ locally ，支持 custom databases。
原始来源
FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills
https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-local-blast
- 维护者
- FreedomIntelligence
- 许可
- MIT
- 最近更新
- 2026年4月1日
技能摘要
来自 SKILL.md 的关键信息
核心说明
- 运行 BLAST searches locally ，使用 NCBI BLAST+ command-line tools。
- sudo apt install ncbi-blast+。
原始文档
SKILL.md 摘录
BLAST+ Programs
| Command | Query | Database | Description |
|---|---|---|---|
blastn | DNA | DNA | Nucleotide-nucleotide |
blastp | Protein | Protein | Protein-protein |
blastx | DNA | Protein | Translated query vs protein |
tblastn | Protein | DNA | Protein vs translated DB |
tblastx | DNA | DNA | Translated vs translated |
makeblastdb | - | - | Create BLAST database |
Create nucleotide database
makeblastdb -in sequences.fasta -dbtype nucl -out my_db
Create protein database
makeblastdb -in proteins.fasta -dbtype prot -out my_proteins
适用场景
- Use bio-local-blast in 科研工作流 aligned ，支持 this subject area。
- Follow upstream documentation ，用于 full working procedure。
不适用场景
- Do not assume this entry replaces original database documentation 或 API notes。
上游相关技能
- blast-searches - Remote BLAST via NCBI (no installation needed)
- sequence-io - Read/write FASTA files for queries
- batch-downloads - Download sequences to build local databases
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