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BI
bio-population-genetics-association-testing
维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日
GWAS association testing with PLINK, BOLT-LMM, or SAIGE.
原始来源
FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills
https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-population-genetics-association-testing
- 维护者
- FreedomIntelligence
- 许可
- MIT
- 最近更新
- 2026年4月1日
技能摘要
来自 SKILL.md 的关键信息
核心说明
- GWAS analysis ，使用 PLINK 2.0's unified --glm command ，用于 case-control 、 quantitative traits。
- plink2 --bfile data --glm --out results。
原始文档
SKILL.md 摘录
With phenotype file
plink2 --bfile data --pheno pheno.txt --glm --out results
## Linear regression for quantitative traits
plink2 --bfile data --pheno pheno.txt --glm --out results
Include covariates (sex, age, PCs)
plink2 --bfile data
--pheno pheno.txt
--covar covariates.txt
--glm --out results
适用场景
- Use bio-population-genetics-association-testing ，用于 genomics 、 bioinformatics workflows。
- Apply bio-population-genetics-association-testing to sequencing，variant，或 omics analysis tasks。
不适用场景
- Do not rely on this catalog entry alone ，用于 installation 或 maintenance details。
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- population-structure - PCA for stratification control
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