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BI
bio-population-genetics-population-structure
维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日
Population stratification with PCA, ADMIXTURE, and STRUCTURE.
原始来源
FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills
https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-population-genetics-population-structure
- 维护者
- FreedomIntelligence
- 许可
- MIT
- 最近更新
- 2026年4月1日
技能摘要
来自 SKILL.md 的关键信息
核心说明
- 分析 genetic ancestry 、 population stratification ，使用 PCA 、 ADMIXTURE。
- plink2 --bfile data --pca 10 --out pca_results。
原始文档
SKILL.md 摘录
More PCs
plink2 --bfile data --pca 20 --out pca_results
Approximate PCA (faster for large datasets)
plink2 --bfile data --pca 10 approx --out pca_results
Output variant loadings
plink2 --bfile data --pca 10 var-wts --out pca_results
适用场景
- Use bio-population-genetics-population-structure ，用于 genomics 、 bioinformatics workflows。
- Apply bio-population-genetics-population-structure to sequencing，variant，或 omics analysis tasks。
不适用场景
- Do not rely on this catalog entry alone ，用于 installation 或 maintenance details。
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- linkage-disequilibrium - LD pruning details
- association-testing - Use PCs as covariates
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