数据与复现生物信息与基因组学FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills数据与复现

bio-small-rna-seq-target-prediction

维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日

Predict miRNA target genes with TargetScan or miRDB.

OpenClawNanoClaw分析处理复现实验bio-small-rna-seq-target-prediction🧠 bioos extended suitebioos extended bioinformatics suitepredict

原始来源

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills

https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-small-rna-seq-target-prediction

技能摘要

2 min

miranda miRNA.fa UTRs.fa \ -sc 140 \ -en -20 \ -out predictions.txt。
def get_validated_targets(mirna)：'''Get experimentally validated targets ，面向 miRTarBase''' # Download ，面向 https：//mirtarbase.cuhk.edu.cn/ mirtarbase_file = 'miRTarBase_MTI.xlsx。
df = pd.read_excel(mirtarbase_file) validated = df[df['miRNA'] == mirna] return validated[['Target Gene'，'Experiments'，'Support Type']]。

原始文档

miranda miRNA.fa UTRs.fa
-sc 140
-en -20
-out predictions.txt

Use bio-small-rna-seq-target-prediction ，用于 genomics 、 bioinformatics workflows。
Apply bio-small-rna-seq-target-prediction to sequencing，variant，或 omics analysis tasks。