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bio-systems-biology-model-curation

维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日

Curate SBML metabolic models: mass/charge balance, gap filling.

OpenClawNanoClaw分析处理复现实验bio-systems-biology-model-curation🧠 bioos extended suitebioos extended bioinformatics suitecurate

原始来源

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills

https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-systems-biology-model-curation

维护者
FreedomIntelligence
许可
MIT
最近更新
2026年4月1日

技能摘要

来自 SKILL.md 的关键信息

2 min

核心说明

  • memote report snapshot model.xml --filename report.html。
  • memote run --pytest-args "--tb=short" model.xml。

原始文档

SKILL.md 摘录

Memote Python API

import memote
import cobra

model = cobra.io.read_sbml_model('model.xml')

## Run all tests

result = memote.suite.api.run(model)

## Get score breakdown

scores = memote.suite.api.snapshot(model)
print(f"Total score: {scores['score']['total_score']:.2%}")

适用场景

  • Use bio-systems-biology-model-curation ,用于 genomics 、 bioinformatics workflows。
  • Apply bio-systems-biology-model-curation to sequencing,variant,或 omics analysis tasks。

不适用场景

  • Do not rely on this catalog entry alone ,用于 installation 或 maintenance details。

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