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bio-tcr-bcr-analysis-repertoire-visualization

维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日

bio-tcr-bcr-analysis-repertoire-visualization:创建 publication-quality visualizations of immune repertoire data ,涵盖 circos plots,clone tracking,diversity plots,、 network graphs。 适合在generating figures ,用于 repertoire comparisons,clonal dynamics,或 V(D)J gene usage时使用。

OpenClawNanoClaw分析处理写作整理bio-tcr-bcr-analysis-repertoire-visualization🧬 bioinformatics (gptomics bio-* suite)bioinformatics — immunoinformatics & flow cytometrycreate

原始来源

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills

https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-tcr-bcr-analysis-repertoire-visualization

维护者
FreedomIntelligence
许可
MIT
最近更新
2026年4月1日

技能摘要

来自 SKILL.md 的关键信息

2 min

核心说明

  • CLI:vdjtools PlotFancyVJUsage ,用于 circos-style V-J plots。
  • Python:matplotlib/seaborn ,用于 custom repertoire visualizations。
  • 可视化 my immune repertoire data" → Create 论文级图表 ,用于 TCR/BCR repertoires ,涵盖 circos plots,V(D)J gene usage heatmaps,diversity plots,、 clonal tracking across samples. CLI:vdjtools PlotFancyVJUsage ,用于 circos-style V-J plots Python:matplotlib/seaborn ,用于 custom repertoire visualizations。
  • vdjtools PlotFancyVJUsage \ -m metadata.txt \ output_dir/。

原始文档

SKILL.md 摘录

Repertoire Visualization

"Visualize my immune repertoire data" → Create publication-quality figures for TCR/BCR repertoires including circos plots, V(D)J gene usage heatmaps, diversity plots, and clonal tracking across samples.

  • CLI: vdjtools PlotFancyVJUsage for circos-style V-J plots
  • Python: matplotlib/seaborn for custom repertoire visualizations

适用场景

  • 适合在generating figures ,用于 repertoire comparisons,clonal dynamics,或 V(D)J gene usage时使用。

不适用场景

  • Do not rely on this catalog entry alone ,用于 installation 或 maintenance details。

上游相关技能

  • vdjtools-analysis - Generate input data
  • mixcr-analysis - Generate clonotype tables
  • data-visualization/ggplot2-fundamentals - General plotting concepts

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