数据与复现生物信息与基因组学FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills数据与复现

bio-workflows-multiome-pipeline

维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日

10x Multiome: joint scRNA-seq + scATAC-seq processing and integration.

OpenClawNanoClaw分析处理复现实验bio-workflows-multiome-pipeline🧠 bioos extended suitebioos extended bioinformatics suite10x

原始来源

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills

https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/bio-workflows-multiome-pipeline

维护者: FreedomIntelligence
许可: MIT
最近更新: 2026年4月1日

技能摘要

来自 SKILL.md 的关键信息

2 min

核心说明

Complete workflow ，用于 10X Multiome (joint scRNA + scATAC) analysis ，使用 Seurat 、 Signac。
rna_counts <- Read10X_h5('filtered_feature_bc_matrix.h5')。

原始文档

SKILL.md 摘录

Step 1: Load Multiome Data

library(Seurat)
library(Signac)
library(EnsDb.Hsapiens.v86)
library(ggplot2)

## Create Seurat object with RNA

seurat_obj <- CreateSeuratObject(
    counts = rna_counts$`Gene Expression`,
    assay = 'RNA'
)

## Or from fragments file

frags <- CreateFragmentObject('atac_fragments.tsv.gz', cells = colnames(seurat_obj))

适用场景

Use bio-workflows-multiome-pipeline ，用于 genomics 、 bioinformatics workflows。
Apply bio-workflows-multiome-pipeline to sequencing，variant，或 omics analysis tasks。