CE
cellular-senescence-agent：Cellular senescence analysis：marker scoring，SASP profiling，tissue aging assessment。
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流程自动化
IM
image-analysis
维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日
image-analysis。
原始来源
FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills
https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/image-analysis
- 维护者
- FreedomIntelligence
- 许可
- MIT
- 最近更新
- 2026年4月1日
技能摘要
来自 SKILL.md 的关键信息
核心说明
- 提取 features 、 segment tissue images in spatial transcriptomics data。
- 库_id = list(adata.uns['spatial'].keys())[0] img_dict = adata.uns['spatial'][库_id]['images']。
原始文档
SKILL.md 摘录
High and low resolution images
hires = img_dict['hires'] lowres = img_dict['lowres']
print(f'Hires shape: {hires.shape}') print(f'Lowres shape: {lowres.shape}')
Get scale factors
scalef = adata.uns['spatial'][library_id]['scalefactors'] spot_diameter = scalef['spot_diameter_fullres'] hires_scale = scalef['tissue_hires_scalef']
## Squidpy's ImageContainer for organized image handling
img = sq.im.ImageContainer(adata.uns['spatial'][library_id]['images']['hires'])
print(img)
适用场景
- Use image-analysis in 科研工作流 aligned ，支持 this subject area。
- Follow upstream documentation ，用于 full working procedure。
不适用场景
- Do not rely on this catalog entry alone ，用于 installation 或 maintenance details。
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- spatial-visualization - Visualize images with expression
- spatial-domains - Use image features for domain detection
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