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数据与复现
MC
mcpmed-bioinformatics-server
维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日
Model Context Protocol (MCP) server for bioinformatics web services like GEO, STRING, and UCSC Cell Browser.
原始来源
FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills
https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/mcpmed-bioinformatics-server
- 维护者
- FreedomIntelligence
- 许可
- MIT
- 最近更新
- 2026年4月1日
技能摘要
来自 SKILL.md 的关键信息
核心说明
- Adapts Model Context Protocol (MCP) to bioinformatics web server backends. This creates standardized，machine-actionable layer ，用于 LLMs to interact ，支持 external biological resources，matching 2026 standard ，用于 agentic tools。
- Query STRING database ，用于 protein-protein interactions ，通过 MCP。
- Fetch 数据集 metadata ，面向 GEO ，使用 MCPmed。
- 访问 UCSC Cell Browser data through MCP。
- Query STRING database ，用于 protein-protein interactions ，通过 MCP" "Fetch 数据集 metadata ，面向 GEO ，使用 MCPmed" * "Access UCSC Cell Browser data through MCP。
原始文档
SKILL.md 摘录
Core Capabilities
- GEO Integration: Search and retrieve Gene Expression Omnibus metadata autonomously.
- STRING DB Access: Query protein-protein interaction networks contextually.
- UCSC Cell Browser: Programmatic access to single-cell datasets.
Workflow
- Step 1: Start the MCPmed server to expose the bioinformatics backend tools.
- Step 2: Connect the LLM client using MCP to query the integrated databases.
Example Usage
User: "Query the STRING database for interactions with TP53."
Agent Action:
适用场景
- Query STRING database ，用于 protein-protein interactions ，通过 MCP。
- Fetch 数据集 metadata ，面向 GEO ，使用 MCPmed。
- 访问 UCSC Cell Browser data through MCP。
不适用场景
- Do not rely on this catalog entry alone ，用于 installation 或 maintenance details。
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