CE
cellular-senescence-agent：Cellular senescence analysis：marker scoring，SASP profiling，tissue aging assessment。
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流程自动化
SP
spatial-data-io
维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日
spatial-data-io。
原始来源
FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills
https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/spatial-data-io
- 维护者
- FreedomIntelligence
- 许可
- MIT
- 最近更新
- 2026年4月1日
技能摘要
来自 SKILL.md 的关键信息
核心说明
- Load 、 work ，支持 spatial transcriptomics data ，面向 various 平台s。
- adata = sq.read.visium('path/to/spaceranger/output/') print(f'Loaded {adata.n_obs} spots，{adata.n_vars} genes')。
原始文档
SKILL.md 摘录
Spatial coordinates are in adata.obsm['spatial']
print(f"Spatial coords shape: {adata.obsm['spatial'].shape}")
Image is in adata.uns['spatial']
library_id = list(adata.uns['spatial'].keys())[0] print(f'Library ID: {library_id}')
## Alternative using Scanpy directly
adata = sc.read_visium('path/to/spaceranger/output/')
适用场景
- Use spatial-data-io in 科研工作流 aligned ，支持 this subject area。
- Follow upstream documentation ，用于 full working procedure。
不适用场景
- Do not rely on this catalog entry alone ，用于 installation 或 maintenance details。
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- spatial-preprocessing - QC and normalization after loading
- spatial-visualization - Plot spatial data
- single-cell/data-io - Non-spatial scRNA-seq data loading
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