流程自动化科研基础设施FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills数据与复现

spatial-domains

维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日

spatial-domains。

OpenClawNanoClaw分析处理复现实验spatial-domainsopenclaw medical skillsadditional scientific toolsspatial

原始来源

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills

https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/spatial-domains

维护者: FreedomIntelligence
许可: MIT
最近更新: 2026年4月1日

技能摘要

来自 SKILL.md 的关键信息

2 min

核心说明

Identify spatial domains 、 tissue regions by combining expression 、 spatial information。
sc.pp.neighbors(adata，n_neighbors=15，n_pcs=30) sc.tl.leiden(adata，resolution=0.5，key_added='leiden')。

原始文档

SKILL.md 摘录

Visualize on tissue

sq.pl.spatial_scatter(adata, color='leiden', size=1.3)


## Build spatial neighbors

sq.gr.spatial_neighbors(adata, coord_type='generic', n_neighs=6)

## Run Leiden on spatial graph

sc.tl.leiden(adata, resolution=0.5, key_added='spatial_leiden', neighbors_key='spatial_neighbors')

sq.pl.spatial_scatter(adata, color='spatial_leiden', size=1.3)