CE
cellular-senescence-agent：Cellular senescence analysis：marker scoring，SASP profiling，tissue aging assessment。
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流程自动化
SP
spatial-multiomics
维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日
spatial-multiomics。
原始来源
FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills
https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/spatial-multiomics
- 维护者
- FreedomIntelligence
- 许可
- MIT
- 最近更新
- 2026年4月1日
技能摘要
来自 SKILL.md 的关键信息
核心说明
- adata = sc.read_h5ad('spatial_multiomics.h5ad')。
- sq.gr.spatial_neighbors(adata，coord_type='generic'，n_neighs=10，spatial_key='spatial')。
原始文档
SKILL.md 摘录
Platform Comparison
| Platform | Resolution | Spots/Beads | Coverage |
|---|---|---|---|
| Visium | 55 µm | ~5,000 | Tissue-wide |
| Visium HD | 2 µm | ~11M | Subcellular |
| Slide-seq | 10 µm | ~100,000 | High-density |
| Stereo-seq | 0.5 µm | >200M | Subcellular |
| MERFISH | Single-molecule | N/A | Targeted genes |
Squidpy for High-Resolution Data
import squidpy as sq
import scanpy as sc
## Spatial autocorrelation (Moran's I)
sq.gr.spatial_autocorr(adata, mode='moran', genes=adata.var_names[:100])
适用场景
- Use spatial-multiomics in 科研工作流 aligned ，支持 this subject area。
- Follow upstream documentation ，用于 full working procedure。
不适用场景
- Do not rely on this catalog entry alone ，用于 installation 或 maintenance details。
上游相关技能
- spatial-transcriptomics/spatial-preprocessing - Standard spatial analysis
- single-cell/preprocessing - scRNA-seq concepts
- spatial-transcriptomics/image-analysis - Morphology processing
- single-cell/cell-annotation - Cell type assignment
相关技能
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流程自动化
consensus-sequences
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