CE
cellular-senescence-agent：Cellular senescence analysis：marker scoring，SASP profiling，tissue aging assessment。
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流程自动化
SP
spatial-preprocessing
维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日
spatial-preprocessing。
原始来源
FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills
https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/spatial-preprocessing
- 维护者
- FreedomIntelligence
- 许可
- MIT
- 最近更新
- 2026年4月1日
技能摘要
来自 SKILL.md 的关键信息
核心说明
- QC，filtering，normalization，、 feature selection ，用于 spatial data。
- sc.pp.calculate_qc_metrics(adata，inplace=True)。
原始文档
SKILL.md 摘录
View QC columns
print(adata.obs[['total_counts', 'n_genes_by_counts']].describe()) print(adata.var[['total_counts', 'n_cells_by_counts']].describe())
## Mark mitochondrial genes
adata.var['mt'] = adata.var_names.str.startswith('MT-')
## Calculate percent mitochondrial
sc.pp.calculate_qc_metrics(adata, qc_vars=['mt'], inplace=True)
print(f"Mean MT%: {adata.obs['pct_counts_mt'].mean():.1f}")
适用场景
- Use spatial-preprocessing in 科研工作流 aligned ，支持 this subject area。
- Follow upstream documentation ，用于 full working procedure。
不适用场景
- Do not rely on this catalog entry alone ，用于 installation 或 maintenance details。
上游相关技能
- spatial-data-io - Load spatial data
- spatial-neighbors - Build spatial graphs
- single-cell/preprocessing - Non-spatial preprocessing
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