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spatial-visualization

维护者 FreedomIntelligence · 最近更新 2026年4月1日

spatial-visualization。

OpenClawNanoClaw分析处理写作整理spatial-visualizationopenclaw medical skillsadditional scientific toolsspatial

原始来源

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills

https://github.com/FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills/tree/main/skills/spatial-visualization

维护者
FreedomIntelligence
许可
MIT
最近更新
2026年4月1日

技能摘要

来自 SKILL.md 的关键信息

2 min

核心说明

  • 创建 visualizations ,用于 spatial transcriptomics data。
  • sq.pl.spatial_scatter(adata,color='total_counts',size=1.3)。

原始文档

SKILL.md 摘录

Multiple variables

sq.pl.spatial_scatter(adata, color=['total_counts', 'n_genes_by_counts'], ncols=2)


## Scanpy's spatial plot

sc.pl.spatial(adata, color='leiden', spot_size=1.5)

## Multiple genes

sc.pl.spatial(adata, color=['GENE1', 'GENE2', 'GENE3'], ncols=3)

适用场景

  • Use spatial-visualization to prepare 论文级图表。
  • Apply spatial-visualization when results need clear visual communication。

不适用场景

  • Do not rely on this catalog entry alone ,用于 installation 或 maintenance details。

上游相关技能

  • spatial-data-io - Load spatial data
  • spatial-statistics - Compute statistics to visualize
  • single-cell/clustering - Generate cluster labels

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